Trypanosomy
Trypanosoma brucei, pasożyt, który jest odpowiedzialny za afrykańską śpiączkę, myli ludzki system immunologiczny poprzez zmianę grubej warstwy glikoprotein powierzchniowych w każdym cyklu infekcyjnym. Glikoproteiny te są identyfikowane przez układ odpornościowy jako obce antygeny, co powoduje powstanie specyficznej obrony przeciwciał przeciwko pasożytowi. Jednakże T. brucei posiada tysiące możliwych antygenów; z każdym kolejnym pokoleniem protist przestawia się na powłokę glikoproteinową o innej strukturze molekularnej. W ten sposób T. brucei jest zdolny do ciągłej replikacji, przy czym układ odpornościowy nigdy nie jest w stanie usunąć pasożyta. Bez leczenia, T. brucei atakuje czerwone krwinki, powodując zapadnięcie pacjenta w śpiączkę i w końcu jego śmierć. W okresach epidemii śmiertelność z powodu tej choroby może być wysoka. Większy nadzór i środki kontroli prowadzą do zmniejszenia liczby zgłaszanych przypadków; jedne z najniższych od 50 lat (mniej niż 10 000 przypadków w całej Afryce Subsaharyjskiej) odnotowano od 2009 roku.
W Ameryce Łacińskiej inny gatunek, T. cruzi, jest odpowiedzialny za chorobę Chagasa. Zakażenia T. cruzi są wywoływane głównie przez krwiopijnego robaka. Pasożyt zasiedla tkanki serca i układu pokarmowego w przewlekłej fazie zakażenia, prowadząc do niedożywienia i niewydolności serca z powodu nieprawidłowego rytmu serca. Szacuje się, że 10 milionów ludzi jest zarażonych chorobą Chagasa; w 2008 roku spowodowała ona 10 000 zgonów.