Blackett Family DNA Activity 2
Was ist ein Short Tandem Repeat Polymorphismus (STR)?
Der größte Teil unserer DNA ist identisch mit der DNA von anderen. Es gibt jedoch vererbte Bereiche unserer DNA, die sich von Mensch zu Mensch unterscheiden können. Variationen in der DNA-Sequenz zwischen Individuen werden als „Polymorphismen“ bezeichnet. 
Wie wir in dieser Aktivität entdecken werden, sind Sequenzen mit dem höchsten Grad an Polymorphismus sehr nützlich für DNA-Analysen in forensischen Fällen und Vaterschaftstests. Diese Aktivität basiert auf der Analyse der Vererbung einer Klasse von DNA-Polymorphismen, die als „Short Tandem Repeats“ oder einfach STRs bekannt sind.
STRs sind kurze DNA-Sequenzen, normalerweise mit einer Länge von 2-5 Basenpaaren, die zahlreiche Male kopf-schwanzförmig wiederholt werden, d.h. die 16 bp Sequenz von „gatagatagatagata“ würde 4 Kopf-Schwanz-Kopien des Tetrameren „gata“ darstellen. Die Polymorphismen in STRs sind auf die unterschiedliche Anzahl von Kopien des Repeat-Elements zurückzuführen, die in einer Population von Individuen vorkommen können.
D7S280
D7S280 ist einer der 13 genetischen Kernloci von CODIS STR. Diese DNA befindet sich auf dem menschlichen Chromosom 7. Die DNA-Sequenz eines repräsentativen Allels dieses Locus ist unten dargestellt. Diese Sequenz stammt aus GenBank, einer öffentlichen DNA-Datenbank. Die tetramerische Wiederholungssequenz von D7S280 ist „gata“. Verschiedene Allele dieses Locus haben zwischen 6 und 15 Tandemwiederholungen der „gata“-Sequenz. Wie viele tetramerische Wiederholungen sind in der unten gezeigten DNA-Sequenz vorhanden? Beachten Sie, dass eine der tetrameren Sequenzen „gaca“ und nicht „gata“ ist.
1 aatttttgta ttttttttag agacggggtt tcaccatgtt ggtcaggctg actatggagt 61 tattttaagg ttaatatata taaagggtat gatagaacac ttgtcatagt ttagaacgaa121 ctaacgatag atagatagat agatagatag atagatagat agatagatag atagacagat181 tgatagtttt tttttatctc actaaatagt ctatagtaaa catttaatta ccaatatttg241 gtgcaattct gtcaatgagg ataaatgtgg aatcgttata attcttaaga atatatattc301 cctctgagtt tttgatacct cagattttaa ggcc
Einführung: Überblick | STR P | CODIS | Analyse | Vererbung | Häufigkeitsberechnung.
Aktivitäten: Stammbaum | Daten sammeln | Vaterschaftstest | Vermisste Person | RCMP freq. calc.
