La Escuela de Iluminación de Ramtha es considerada una secta por varias personas, entre ellas su ex marido Jeff Knight, su ex guardaespaldas personal Glen Cunningham, antiguos alumnos de la escuela (como David McCarthy o Joe Szimhart), y el escéptico Michael Shermer. El libro de Melton, que niega la condición de secta de la escuela, ha sido criticado por ponerse del lado de la escuela y no ofrecer una descripción neutral de lo que ocurre en ella. También ha sido llamado «apologista de la secta» por varios opositores a las sectas. Su posición fue aún más criticada cuando subió al estrado como testigo en el caso de Knight contra Knight (1992-1995) contra Jeff Knight (el marido de JZ Knight en ese momento), apoyando además que la escuela no es una secta.
Señal a lo largo de la WA 510. La entrada a la Escuela de Iluminación de Ramtha está al fondo a la izquierda.
Ex alumnos de la escuela han acusado a la RSE de practicar el lavado de cerebro y el control mental, así como de utilizar técnicas de intimidación y miedo para mantener a los alumnos en la escuela. David McCarthy, alumno de la RSE entre 1989 y 1996, califica a Knight de «depredador espiritual», y menciona varias partes de las enseñanzas que tenían un carácter intimidador, como la profecía de que, a menos que los estudiantes se mantengan fieles a Ramtha, se convertirán en presa de la «gente lagarto», y que la antigua figura de Jehová regresaría a la tierra acompañada de gente lagarto, en una nave espacial. Los antiguos alumnos (entre los que se encuentran David McCarthy y Joe Szimhart) han formado una comunidad en línea, Life After RSE (LARSE), para ofrecer apoyo a las personas que han abandonado la escuela y se encuentran perdidas.
Otro tema controvertido en relación con las enseñanzas de Ramtha tiene que ver con los llamados «días venideros», que fueron profetizados como cambios en la tierra. Se dieron instrucciones supuestamente procedentes de Ramtha a los estudiantes, diciéndoles que abandonaran las ciudades, que buscaran un lugar en el campo para cultivar sus propios alimentos y que se convirtieran en soberanos o autosuficientes. Otra instrucción se les dijo a los estudiantes que construyeran refugios subterráneos para protegerse a sí mismos y a sus familias.
Varios incidentes dentro de los terrenos de la escuela han sido caracterizados como controvertidos. Glen Cunningham, en una entrevista con David McCarthy, describe cómo, una noche, Knight sugirió que todos los estudiantes se quedaran allí durante la noche porque dijo que sería «bueno para la energía». Eso fue antes de que la Gran Arena (antiguamente utilizada como cuadra de caballos) hubiera sido pavimentada, y como resultado habría mucho polvo en el aire. Cunningham cuenta que había una mujer muy anciana entre los estudiantes, que le rogó que no quería hacer esto y que quería irse a casa, pero Ramtha le dijo que podía quedarse bajo la protección de Ramtha y su guardaespaldas. Al salir de la arena al día siguiente, la anciana murió de neumonía (debido al polvo del aire y la humedad).
Otro incidente que mencionan tanto Cunningham como Joe Szimhart es la práctica de correr con los ojos vendados en un gran campo vallado. Szimhart menciona en particular una ocasión en torno al año 1990, en la que se ordenó a unos 1.000 estudiantes con los ojos vendados que se dividieran y corrieran por el campo, con las manos en la posición de «Conciencia & Energía» delante de ellos, y el ejercicio pretendía ayudar a los estudiantes a superar sus miedos. Szimhart recuerda que muchas personas chocaron entre sí y que hubo algunos heridos. Un cliente suyo acabó con un hombro muy magullado y un gran bulto en la frente. Aparte de las heridas leves, unas cuantas personas tuvieron que ser atendidas en el hospital.
En 2011, Knight declaró (mientras estaba en la RSE supuestamente canalizando a Ramtha): «¡Que se jodan los elegidos de Dios! Creo que ya han ganado suficiente dinero para haber pagado su salida de las malditas cámaras de gas», y dijo que los mexicanos «se reproducen como conejos» y son «veneno», que todos los homosexuales solían ser sacerdotes católicos y que los agricultores orgánicos tienen mala higiene. En 2012, videos de esto fueron colocados en Internet por ex alumnos de Knight y por la Fundación de la Libertad.