Nombrado en honor al presidente favorito de su padre, Abraham Lincoln, y llamado por su segundo nombre, Lincoln Borglum fue el primer hijo de Gutzon Borglum y su segunda esposa, Mary Montgomery Williams (1874-1955). Durante su juventud, Lincoln acompañó a su padre a las Colinas Negras de Dakota del Sur y estuvo presente cuando se seleccionó el emplazamiento del monumento del Monte Rushmore. Aunque originalmente había planeado estudiar ingeniería en la Universidad de Virginia, Lincoln Borglum comenzó a trabajar en el monumento en 1933 a la edad de 21 años como puntero no remunerado.
Lincoln Borglum pasó rápidamente a una serie de trabajos más importantes: Fue puesto en nómina en 1934, ascendido a escultor asistente en 1937, y promovido a superintendente en 1938 con un salario anual de 4.800 dólares.
Gutzon Borglum casi había completado las cabezas de 60 pies de los cuatro presidentes (Washington, Jefferson, Lincoln y T. Roosevelt) cuando murió el 6 de marzo de 1941. Lincoln Borglum tuvo que abandonar los ambiciosos planes de su padre de llevar la obra hasta incluir los torsos de los presidentes y un entablamento debido a la falta de financiación; dejó el monumento en gran parte en el estado de terminación que había alcanzado bajo la dirección de su padre.
Borglum fue nombrado primer superintendente del Monumento Nacional del Monte Rushmore y comenzó a ejercer su cargo el 1 de octubre de 1941. Las obras del monumento se detuvieron oficialmente el 31 de octubre de 1941. Ejerció ese cargo hasta el 15 de mayo de 1944.
Borglum siguió trabajando como escultor después de dejar el Monte Rushmore. Creó varias obras religiosas para iglesias de Texas, incluyendo el conocido santuario Nuestra Señora de Loreto en Goliad. Borglum también escribió tres libros sobre la escultura del Monte Rushmore.
Lincoln Borglum era miembro de la Logia Masónica Battle River nº 92 de Hermosa, Dakota del Sur. Al igual que muchos de los hombres que trabajaron en el proyecto Rushmore, los pulmones de Borglum quedaron permanentemente marcados por respirar el polvo de granito asociado a las voladuras. Borglum murió en Corpus Christi, Texas, a la edad de 73 años.