Las calizas se originan principalmente por la litificación de sedimentos carbonatados sueltos. Los sedimentos carbonatados modernos se generan en una variedad de ambientes: continentales, marinos y de transición, pero la mayoría son marinos. Los actuales bancos de Bahamas son el entorno carbonatado moderno más conocido. Se trata de una amplia plataforma submarina cubierta por aguas marinas cálidas y poco profundas. La plataforma de Bahamas, o plataforma de carbonatos, imita el entorno que prevaleció repetidamente a través de las áreas cratónicas estables de los principales bloques continentales durante el Precámbrico tardío, el Paleozoico y el Mesozoico, y sirve como modelo para explicar los diversos tipos de caliza que componen estas antiguas sucesiones de carbonatos.
El borde de la plataforma está marcado por un escarpe topográficamente afilado flanqueado por brechas de caliza gruesas y angulares. Los canales submarinos grabados en la escarpa sirven como vías de agua por las que los sedimentos carbonatados de aguas poco profundas pueden ser transportados por corrientes de turbidez capaces de redistribuirlos como depósitos en forma de delantal en la llanura abisal oceánica. En muchas zonas, la franja de los bancos de las Bahamas está marcada por rocas arrecifales resistentes al oleaje (a veces clasificadas como boundstone). La abrasión de estos arrecifes por la actividad de las olas genera abundantes restos esqueléticos. Las variaciones en la profundidad y la fuerza de la corriente controlan las cantidades relativas de micrita y esparita, la prevalencia de organismos específicos y su productividad, y la probabilidad de generar ooides, pellets y fragmentos de roca carbonatada. La micrita y los sedimentos micríticos alóctonos se acumulan en las zonas protegidas de aguas profundas y de baja energía, como las lagunas y las marismas, y en el lado de sotavento de las islas principales. En los lugares de alta energía y aguas poco profundas, como las playas, las dunas costeras y los canales de marea, las corrientes eliminan la micrita y se convierten en lugares de deposición de sedimentos aloquímicos dispersos. Para determinar el lugar exacto de deposición de un antiguo depósito de carbonatos se requiere un análisis detallado de su textura, composición, estructuras sedimentarias, geometría, contenido fósil y relaciones estratigráficas con los modernos lugares de deposición de carbonatos.
Además de los antiguos análogos de los modernos depósitos de carbonatos descritos anteriormente, existen calizas de agua dulce (margas) y lodos calcáreos (o calcilutitas) de las llanuras abisales de aguas profundas. Las calizas de agua dulce de extensión limitada representan un espectro de entornos a pequeña escala desarrollados dentro y a lo largo de los márgenes de las cuencas lacustres. Las calizas de las llanuras abisales de aguas profundas tienen un volumen y una edad bastante restringidos en el registro geológico por varias razones. En primer lugar, es menos probable que las secuencias de llanura abisal se incorporen a los cinturones orogénicos que se desarrollan cuando los márgenes continentales se comprimen durante el cierre de la cuenca oceánica. En segundo lugar, los exudados calcáreos pelágicos son los análogos modernos evidentes de las antiguas calcilutitas de llanura abisal. Estos exudados son producidos por el plancton que segrega aragonito y que flota cerca de la superficie (como los foraminíferos y los cocolitos), que al morir dejan sus conchas, o pruebas, para depositarse lentamente en el fondo del océano y acumularse. Por lo tanto, el desarrollo de estos depósitos de aguas profundas depende obviamente de la existencia de organismos planctónicos que segregan calcio, y éstos no evolucionaron hasta el Mesozoico. Por último, la acumulación de exudado calcáreo está muy restringida tanto por la latitud (se limita en gran medida a una franja que se extiende entre 30° y 40° al norte y al sur del Ecuador) como por la profundidad de la llanura abisal (aproximadamente 2.000 metros). Por debajo de una profundidad de unos 4.500 metros, que es la profundidad de compensación de carbonatos (CCD), la presión y la temperatura del agua de mar producen una tasa de disolución superior a la tasa de acumulación de pruebas pelágicas.