Qué es una repetición corta en tándem

Actividad de ADN de la familia Blackett 2

¿Qué es un polimorfismo de repetición corta en tándem (STR)?

La mayor parte de nuestro ADN es idéntico al de otros. Sin embargo, hay regiones heredadas de nuestro ADN que pueden variar de una persona a otra. Las variaciones en la secuencia de ADN entre individuos se denominan «polimorfismos». Como descubriremos en esta actividad, las secuencias con mayor grado de polimorfismo son muy útiles para el análisis de ADN en casos forenses y pruebas de paternidad. Esta actividad se basa en el análisis de la herencia de una clase de polimorfismos de ADN conocidos como «Short Tandem Repeats», o simplemente STRs.

Los STRs son secuencias cortas de ADN, normalmente de longitud 2-5 pares de bases, que se repiten numerosas veces de forma cabeza-cola, es decir, la secuencia de 16 pb de «gatagatagata» representaría 4 copias cabeza-cola del tetrámero «gata». Los polimorfismos en los STRs se deben al diferente número de copias del elemento de repetición que puede darse en una población de individuos.

D7S280

El D7S280 es uno de los 13 loci genéticos STR centrales del CODIS. Este ADN se encuentra en el cromosoma 7 humano. La secuencia de ADN de un alelo representativo de este locus se muestra a continuación. Esta secuencia procede de GenBank, una base de datos pública de ADN. La secuencia de repetición tetramérica de D7S280 es «gata». Los diferentes alelos de este locus tienen de 6 a 15 repeticiones en tándem de la secuencia «gata». ¿Cuántas repeticiones tetraméricas hay en la secuencia de ADN que se muestra a continuación? Observa que una de las secuencias tetraméricas es «gaca», en lugar de «gata».

 1 aatttttgta ttttttttag agacggggtt tcaccatgtt ggtcaggctg actatggagt 61 tattttaagg ttaatatata taaagggtat gatagaacac ttgtcatagt ttagaacgaa121 ctaacgatag atagatagat agatagatag atagatagat agatagatag atagacagat181 tgatagtttt tttttatctc actaaatagt ctatagtaaa catttaatta ccaatatttg241 gtgcaattct gtcaatgagg ataaatgtgg aatcgttata attcttaaga atatatattc301 cctctgagtt tttgatacct cagattttaa ggcc

Introducción: Visión general | STR P | CODIS | Análisis | Herencia | Cálculo de frecuencias.

Actividades : Pedigrí | Recoger datos | Pruebas de paternidad | Persona desaparecida | RCMP freq. calc.

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