Prawa i lewa komora boczna to struktury w mózgu, które zawierają płyn mózgowo-rdzeniowy, przezroczysty, wodnisty płyn, który zapewnia amortyzację dla mózgu, pomagając jednocześnie w krążeniu składników odżywczych i usuwaniu odpadów.
Wraz ze strukturami znanymi jako trzecia komora i czwarta komora, komory boczne są częścią układu komorowego organizmu. Układ komorowy działa jako kontynuacja kanału centralnego rdzenia kręgowego, podobnej struktury, która zawiera płyn mózgowo-rdzeniowy i biegnie wzdłuż szyi i tułowia.
Oddzielne części układu komorowego są połączone przez małe otwory zwane rozwidleniami. Komora boczna i trzecia łączą się przez prawe i lewe rozwidlenie międzykomorowe, natomiast trzecia i czwarta komora łączą się przez otwór zwany akweduktem mózgowym. Inne otwory, które łączą się z konkretnymi komorami istnieją, ale nie są uważane za część systemu komorowego.
Objętość komór bocznych i podobnych struktur w mózgu może być mierzona za pomocą tomografii komputerowej. Skan pozwala lekarzom zmierzyć nie tylko wielkość komór, ale także gęstość płynu mózgowo-rdzeniowego, który zawierają. Informacje te mogą być wykorzystane do zdiagnozowania potencjalnych problemów w mózgu, w tym wodogłowia, nieprawidłowego nagromadzenia płynu w komorach. Wodogłowie może prowadzić do stopniowego powiększania się czaszki.