Als ze een hol maken, De voorpoten schrapen de grond weg, die vervolgens door de achterpoten uit de weg wordt geduwd. Als er stenen in de weg liggen, verwijdert de alpenmarmot die met zijn tanden, op voorwaarde dat de stenen niet te groot zijn. “Leefruimten” ontstaan aan het eind van een hol en zijn vaak bekleed met gedroogd hooi, gras en plantenstengels. Alle andere holentunnels die nergens heen leiden, worden gebruikt als toiletruimte. Als de holen eenmaal klaar zijn, herbergen ze slechts één familie, maar ze worden vaak door de volgende generatie uitgebreid, waardoor in de loop der tijd soms zeer complexe holen ontstaan. Elke alpenmarmot leeft in een groep die uit meerdere holen bestaat, en die een dominant broedpaar heeft. Alpenmarmotten zijn zeer defensief tegenover indringers en waarschuwen hen met intimiderend gedrag, zoals het slaan met de staart en het klapperen van de tanden, en door hun territorium te markeren met hun geur. Vaak kan men een alpenmarmot zien “staan” terwijl hij uitkijkt naar mogelijke roofdieren of andere gevaren. Waarschuwingen worden gegeven door een reeks luide fluittonen te laten horen, waarna men de leden van de kolonie kan zien rennen om dekking te zoeken.
Het paringsseizoen voor alpenmarmotten vindt plaats in de lente, direct nadat hun winterslaap is afgelopen, waardoor hun nakomelingen de grootst mogelijke kans hebben voldoende vet op te slaan om de komende winter te overleven. Alpenmarmotten zijn in staat zich voort te planten zodra ze twee jaar oud zijn. Dominante vrouwtjes hebben de neiging de voortplanting van ondergeschikte marmotten te onderdrukken door tijdens hun zwangerschap vijandig tegen hen te doen, wat stress veroorzaakt en de jongen doodt. Zodra het vrouwtje zwanger is, neemt zij strooisel (zoals gras) mee het hol in voor de bevalling na een draagtijd van 33-34 dagen. Elk nest bestaat uit één tot zeven baby’s, maar meestal zijn het er drie. De baby’s worden blind geboren en krijgen binnen enkele dagen een donkere vacht. De speenperiode duurt nog eens veertig dagen, gedurende welke de moeder de jongen in het hol achterlaat terwijl zij naar voedsel zoekt. Na deze periode komen de jongen uit het hol en gaan zelf op zoek naar vast voedsel. Tegen het einde van de zomer heeft hun pels dezelfde kleur als die van volwassen alpenmarmotten, en na twee jaar zijn ze volgroeid. Als ze in gevangenschap worden gehouden, kunnen alpenmarmotten 15-18 jaar oud worden.
WinterslaapEdit
Alpiene marmotten overleven extreme weersveranderingen en voedseltekorten tijdens de winter door een winterslaap te houden. Als de zomer ten einde loopt, verzamelen Alpenmarmotten oude stengels in hun holen om als strooisel te dienen voor hun naderende winterslaap, die al in oktober kan beginnen. Ze dichten het hol af met een combinatie van aarde en hun eigen uitwerpselen. Zodra de winter is aangebroken, kruipen de alpenmarmotten naast elkaar en beginnen ze aan hun winterslaap, een proces waarbij hun hartslag daalt tot vijf slagen per minuut en hun ademhaling tot 1-3 ademhalingen per minuut. Ineenkruipen naast nestgenoten zorgt voor passieve warmte-uitwisseling en grotere groepen die in winterslaap gaan, zorgen voor een groter overlevingsvermogen. Tijdens de winterslaap worden hun opgeslagen vetvoorraden langzaam aangesproken, waardoor ze meestal de winter overleven. Hun lichaamstemperatuur daalt tot bijna dezelfde temperatuur als de lucht om hen heen, hoewel hun hart- en ademhalingsfrequentie versnelt als de omgeving het vriespunt nadert. Sommige alpenmarmotten komen om van de honger omdat hun vetlagen opraken; dit gebeurt meestal bij jongere exemplaren.