A maioria dos casos de diarreia associada a antibióticos pode ser classificada em duas categorias: casos em que o Clostridium difficile está implicado e casos em que nenhum agente putativo ou mecanismo fisiopatológico reconhecido é reconhecido. A colonização C difficile produz um espectro de condições, que vão desde o transporte assintomático até à colite pseudomembranosa fatal: está implicada em praticamente todos os casos de colite pseudomembranosa e até 25% dos casos de diarreia associada a antibióticos sem colite. A clindamicina é notória pela sua propensão para induzir a colite C difficile, mas na prática actual, as penicilinas de largo espectro e as cefalosporinas são os agentes mais frequentemente implicados, reflectindo a sua utilização generalizada. O tratamento inclui a cessação ou alteração da terapia antimicrobiana quando possível, prestação de cuidados de apoio, e terapia específica destinada a erradicar C difficile se os sintomas forem graves ou persistentes ou se a terapia antibiótica não puder ser descontinuada com segurança. O metronidazol oral ou vancomicina é igualmente eficaz em doenças não complicadas; não foi estabelecida uma terapia óptima para doenças graves. As recidivas ocorrem em até 15% dos casos e não podem ser previstas ou prevenidas com precisão.