Objectivo: O presente estudo visava investigar os efeitos adversos dos medicamentos antitiróides propiltiouracil (PTU) e methimazol (MMI)/carbimazol (CMZ) no tratamento do hipertiroidismo. Métodos: A análise qualitativa foi realizada para estudos identificados numa pesquisa bibliográfica até 20 de Abril de 2019, e foram seleccionados 30 estudos para meta-análise. Os desenhos dos estudos incluíram caso-controlo, randomizado controlado, e coorte retrospectiva. Os pacientes estavam em quatro grupos etários: infância, mães gestantes, adultos mais velhos e outras idades, e todos recebiam PTU ou MMI/CMZ. As reacções adversas ao MMI/CMZ e PTU foram avaliadas e comparadas. Resultados: As probabilidades de lesão da função hepática foram mais elevadas no grupo PTU do que no grupo MMI/CMZ (odds ratio , 2,40; intervalo de confiança de 95% , 1,16 a 4,96; P = .02). As probabilidades de transaminase elevada eram muito mais elevadas no grupo PTU do que no grupo MMI/CMZ (OR, 3,96; 95% CI, 2,49 a 6,28; P<.00001). Não foram encontradas diferenças significativas entre grupos nas probabilidades de bilirrubina elevada, agranulocitose, erupção cutânea, ou urticária; incidência de outros eventos adversos; ou em crianças. As probabilidades de defeitos de nascença durante o primeiro trimestre de gravidez foram maiores no grupo MMI/CMZ do que no grupo PTU (OR, 1,29; 95% CI, 1,09 a 1,53; P = .003). Conclusão: O impacto da PTU na lesão hepática e nos níveis de transaminase é maior do que o do MMI/CMZ, mas não se encontram diferenças significativas entre os grupos nos efeitos das drogas na bilirrubina, agranulocitose e erupção cutânea, urticária, ou em crianças. No tratamento do hipertiroidismo relacionado com a gravidez, a PTU deve ser utilizada no primeiro trimestre e o MMI reservado para utilização no final da gravidez. Abreviaturas: ALT = alanina-aminotransferase; ATD = droga antitiróide; CI = intervalo de confiança; CMZ = carbimazol; GD = doença de Graves; MMI = methimazol; MTU = metiltiouracil; NOS = Escala de Newcastle-Ottawa; OR = odds ratio; PTU = propiltiouracil; RAI = iodo radioactivo.