Micobactérias não tuberculosas (NTM) são agentes patogénicos ambientais importantes que podem causar um amplo espectro de doenças. Os últimos anos trouxeram várias mudanças neste campo em expansão: O número de infecções que podem ser associadas a espécies específicas, bem como o número de novas espécies como agentes etiológicos, explodiu devido ao desenvolvimento de novas ferramentas de diagnóstico. A incidência de infecções disseminadas por Mycobacterium avium complex (MAC) em doentes com VIH está a diminuir com tratamentos anti-HIV mais potentes, enquanto que a taxa de infecção e doença NTM pulmonar, bem como a prevalência da úlcera de Buruli, uma doença crónica, necrosante e progressiva causada por Mycobacterium ulcerans, está a aumentar. As manifestações da doença dependem da interacção entre o patogéneo micobacteriano específico e o sistema imunitário do hospedeiro. Este artigo apresenta uma actualização da epidemiologia, diagnóstico e tratamento da doença pulmonar associada à NTM, linfadenite, doença da pele e dos tecidos moles, infecção do esqueleto e infecções NTM relacionadas com corpos e cateteres estranhos.