Attività del DNA della Famiglia Blackett 2
Cos’è un Polimorfismo a Ripetizione Tandem Corta (STR)?
La maggior parte del nostro DNA è identico a quello degli altri. Tuttavia, ci sono regioni ereditate del nostro DNA che possono variare da persona a persona. Le variazioni nella sequenza del DNA tra gli individui sono chiamate “polimorfismi”. 
Come scopriremo in questa attività, le sequenze con il più alto grado di polimorfismo sono molto utili per l’analisi del DNA nei casi di medicina legale e nei test di paternità. Questa attività si basa sull’analisi dell’eredità di una classe di polimorfismi del DNA conosciuti come “Short Tandem Repeats”, o semplicemente STRs.
Le STRs sono brevi sequenze di DNA, normalmente di lunghezza 2-5 paia di basi, che sono ripetute numerose volte in modo testa-coda, cioè la sequenza di 16 bp di “gatagatagata” rappresenterebbe 4 copie testa-coda del tetramero “gata”. I polimorfismi nelle STR sono dovuti al diverso numero di copie dell’elemento ripetuto che possono verificarsi in una popolazione di individui.
D7S280
D7S280 è uno dei 13 loci genetici STR del nucleo CODIS. Questo DNA si trova sul cromosoma umano 7. La sequenza del DNA di un allele rappresentativo di questo locus è mostrata qui sotto. Questa sequenza proviene da GenBank, un database pubblico del DNA. La sequenza di ripetizione tetramerica di D7S280 è “gata”. Alleli diversi di questo locus hanno da 6 a 15 ripetizioni tandem della sequenza “gata”. Quante ripetizioni tetrameriche sono presenti nella sequenza di DNA mostrata qui sotto? Notate che una delle sequenze tetrameriche è “gaca”, piuttosto che “gata”.
1 aatttttgta ttttttttag agacggggtt tcaccatgtt ggtcaggctg actatggagt 61 tattttaagg ttaatatata taaagggtat gatagaacac ttgtcatagt ttagaacgaa121 ctaacgatag atagatagat agatagatag atagatagat agatagatag atagacagat181 tgatagtttt tttttatctc actaaatagt ctatagtaaa catttaatta ccaatatttg241 gtgcaattct gtcaatgagg ataaatgtgg aatcgttata attcttaaga atatatattc301 cctctgagtt tttgatacct cagattttaa ggcc
Introduzione: Panoramica | STR P | CODIS | Analisi | Ereditarietà | Calcolo della frequenza.
Attività : Pedigree | Raccolta dati | Test di paternità | Persona scomparsa | RCMP freq. calc.
