La plupart des cas de diarrhée associée aux antibiotiques peuvent être classés en deux catégories : les cas dans lesquels Clostridium difficile est impliqué et les cas dans lesquels aucun agent putatif ou mécanisme physiopathologique reconnu n’est reconnu. La colonisation par C difficile produit un éventail de conditions, allant du portage asymptomatique à la colite pseudo-membraneuse mortelle : il est impliqué dans pratiquement tous les cas de colite pseudo-membraneuse et jusqu’à 25 % des cas de diarrhée associée aux antibiotiques sans colite. La clindamycine est connue pour sa propension à induire la colite à C difficile, mais dans la pratique actuelle, les pénicillines et les céphalosporines à large spectre sont les agents les plus fréquemment impliqués, ce qui reflète leur utilisation répandue. Le traitement comprend l’arrêt ou la modification du traitement antimicrobien lorsque cela est possible, la fourniture de soins de soutien et un traitement spécifique visant à éradiquer le C difficile si les symptômes sont graves ou persistants ou si l’antibiothérapie ne peut être interrompue sans risque. Le métronidazole ou la vancomycine par voie orale sont tout aussi efficaces dans la maladie non compliquée ; le traitement optimal de la maladie grave n’a pas été établi. Des rechutes surviennent dans jusqu’à 15% des cas et ne peuvent être prédites ou prévenues avec précision.