Activité ADN de la famille Blackett 2
Qu’est-ce qu’un polymorphisme de répétition en tandem courte (STR) ?
La plupart de notre ADN est identique à celui des autres. Cependant, il existe des régions héritées de notre ADN qui peuvent varier d’une personne à l’autre. Les variations de la séquence d’ADN entre les individus sont appelées « polymorphismes ». 
Comme nous allons le découvrir dans cette activité, les séquences présentant le plus haut degré de polymorphisme sont très utiles pour l’analyse de l’ADN dans les affaires médico-légales et les tests de paternité. Cette activité est basée sur l’analyse de l’hérédité d’une classe de polymorphismes de l’ADN connue sous le nom de « Short Tandem Repeats », ou simplement STRs.
Les STRs sont de courtes séquences d’ADN, normalement d’une longueur de 2 à 5 paires de bases, qui sont répétées de nombreuses fois de manière tête-queue, c’est-à-dire que la séquence de 16 pb de « gatagatagatagata » représenterait 4 copies tête-queue du tétramère « gata ». Les polymorphismes des STR sont dus au nombre différent de copies de l’élément répété qui peuvent se produire dans une population d’individus.
D7S280
D7S280 est l’un des 13 loci génétiques STR de base de CODIS. Cet ADN se trouve sur le chromosome humain 7. La séquence d’ADN d’un allèle représentatif de ce locus est présentée ci-dessous. Cette séquence provient de GenBank, une base de données publique d’ADN. La séquence de répétition tétramérique de D7S280 est « gata ». Les différents allèles de ce locus possèdent de 6 à 15 répétitions en tandem de la séquence « gata ». Combien de répétitions tétramériques sont présentes dans la séquence d’ADN présentée ci-dessous ? Remarquez qu’une des séquences tétramériques est « gaca », plutôt que « gata ».
1 aatttttgta ttttttttag agacggggtt tcaccatgtt ggtcaggctg actatggagt 61 tattttaagg ttaatatata taaagggtat gatagaacac ttgtcatagt ttagaacgaa121 ctaacgatag atagatagat agatagatag atagatagat agatagatag atagacagat181 tgatagtttt tttttatctc actaaatagt ctatagtaaa catttaatta ccaatatttg241 gtgcaattct gtcaatgagg ataaatgtgg aatcgttata attcttaaga atatatattc301 cctctgagtt tttgatacct cagattttaa ggcc
Introduction : Aperçu | STR P | CODIS | Analyse | Héritage | Calcul de fréquence.
Activités : Pedigree | Collecte de données | Recherche de paternité | Personne disparue | Calcul de fréquence GRC.
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